1958年，吳征鎰調昆明，任昆明植物研究所所長。那時，昆明植物所在中國科學院和云南省關懷下，已建成三幢品字型大樓。居中的央一幢含標本館、圖書館和行政辦公室。所長辦公室設在二樓右邊的一間約20平米的房間里。那時這間辦公室還算“闊氣”的了。辦公室的陳設很簡單：滿屋書架，一張是放標本、看標本用的長方桌，還有一張寫字桌加一個簡易沙發。滿屋書籍、滿桌資料加標本是其特色?！拔母铩鼻?，吳老在這間辦公室工作八年，其實除去野外考察、外出公差的時間，在辦公室的時間不足四年。

“文革”十年，他離開這間辦公室也十年，后辦公室設在標本館，與陳介先生共室。以后，因腿傷扶杖而行，為方便他辦公，將辦公室改設在職工宿舍24棟102室，他家的對面。在這里，吳老一待就是二十多年。這間由宿舍改成的辦公室，陳設更加簡易，家具、書架是用舊利廢，書架有木制的、有鐵制的，沙發很陳舊，一目了然，不變的是書籍滿屋，資料滿桌，全然是在書山文海中。在這里，吳老邊讀邊寫，系統總結，完成了《中國被子植物科屬綜論》、《中國植物志（總論）》、《種子植物分布區類型及其起源與分化》、《中國種子植物區系地理》等四部專著，提出了被子植物“八綱系統”的新分類系統以及被子植物“多期、多系、多域”起源理論。也是在這里，吳老腿傷逐漸加重，辦公室轉入對面家里的臥室，就更加簡陋了。與現代的辦公室相比，差之一毫，離之千里。

劉禹錫（字夢得）著《陋室銘》，曰：“山不在高，有仙則名；水不在深，有龍則靈。斯是陋室，唯吾德馨?！庇衷唬骸盁o絲竹之亂耳，無案牘之勞形?！比皇菂抢弦簧谵k公室的寫照?！翱鬃釉唬汉温?？”吳老辦公室乃“南陽諸葛廬，西蜀子云亭”也。